Oncolys BioPharma Inc.為日本上市生技製藥公司，專注於溶瘤病毒(Oncolytic Virus)治療癌症藥物的開發。自2008年起，基亞公司與Oncolys成立策略聯盟，共同研發抗癌藥物OBP 301，並於日本、台灣、韓國推動人體臨床試驗。

MEDINET Co., Ltd.為日本上市生技公司，專注於細胞治療領域，為日本生產並供應細胞製劑的先驅與指標公司，擁有多種細胞生產技術。2019年起本公司與MEDINET在台合作，成為合作夥伴。

NKure Therapeutics 為設立於印度，以研發創新性的細胞與基因治療技術、提供癌症與傳染性疾病解決方案的生物技術公司。2024年起基亞與NKure展開基亞NK細胞技術在印度地區臨床應用上的合作。

以下臨床機構曾在臨床試驗或細胞治療領域中與本公司共同合作：

台灣：台灣大學醫學院附設醫院、台北榮民總醫院、台中榮民總醫院、林口長庚醫院、高雄長庚醫院、中國醫藥大學附設醫院、成功大學醫學院附設醫院、高雄義大醫院、新光醫院、慈濟醫院、秀傳醫院、彰化基督教醫院、馬偕醫院、柳營奇美醫院、萬芳醫院。

韓國：延世大學Severance醫院、延世大學江南Severance醫院、亞洲大學醫院、三星醫療中心、首爾峨山醫院、首爾國立大學醫院、首爾聖母醫院、韓國高大九老醫院、國立釜山大學醫院、國立釜山大學梁山醫院、慶北國立大學醫院。

香港：瑪麗皇后醫院。

中國大陸：上海復旦大學附屬中山醫院、北京協和醫院、北京中國人民解放軍總醫院301醫院、長沙中南大學湘雅三醫院。

以下學研機構曾在產學合作領域中與本公司共同合作：

中央研究院、國家衛生研究院、工業技術研究院、生物技術開發中心、台灣大學、台大醫學院、陽明交通大學、成功大學。