基亞公司的新藥開發業務著重在人體臨床試驗的階段。新藥開發事業處以執行符合美國FDA規範的各期（Phase I, II, II, IV）臨床試驗，且基亞公司擁有市場權利的專案為目的；工作內容包括試驗架構的構思、試驗計畫書設計、醫院暨試驗主持人選擇、試驗的執行與監測、完成研究報告並報請主管機關稽查等等。

基亞公司新藥開發事業處由多位專案經理及臨床試驗專員所組成，所有成員皆具備醫藥護理等專業背景以及多年臨床試驗實務經驗，賦予開發中新藥更高的價值。團隊良好默契與向心力，能夠突破困難完成各項艱鉅任務，使新藥迅速上市，以嘉惠病人。

基亞公司於2001年起與澳洲夥伴普基公司共同開發新藥PI-88；PI-88是天然酵母菌發酵產物，經過磺化作用所得的一種磷酸甘露戊聚糖，動物試驗證實其具有抑制新血管增生及癌細胞轉移的功能。於2001年委託臺大醫院腫瘤醫學部進行「以PI-88治療晚期癌症病人的臨床試驗」，這是第一個引進美國FDA之IND藥品在本土進行第一期（Phase I）之臨床試驗，於2004年完成研究報告。

自2004年開始，基亞公司與臺大醫院、林口長庚總院、台中榮民總醫院、中國醫藥大學附設醫院、成功大學醫學院附設醫院、高雄榮民總醫院合作，執行PI-88抗肝癌的第二期（Phase II）臨床試驗，澳洲夥伴普基公司則以PI-88在澳洲及美國進行其他西方人為主的癌症治療臨床試驗。 PI-88抗肝癌第二期（Phase II）臨床試驗於2006年初完成第一階段的收案，並於當年底完成所有病人的追蹤；2007年4月完成此試驗臨床試驗結果報告的撰寫，將於2007年第三季提交研究報告並完成政府主管機關的稽查。肝癌Phase II臨床試驗的結果顯示，PI-88有效地降低肝癌復發率（復發率從5成降為3成7）並延長復發時間（復發時間從27週延長至48週），同時具有良好的安全性與耐受性。

為進一步觀察使用PI-88病人的長期預後狀況，基亞公司更於2006年底起在前述試驗中心進行長達兩年的後續追蹤臨床研究，更廣泛地蒐集受試者之臨床資料，以追蹤受試者的整體存活率（Overall Survival）及無疾病惡化存活率(Disease Free Survival)，預計2009年完成。澳商普基公司已準備進行PI-88抗肝癌第三期（Phase III）臨床試驗，預計於2007年底進行收案。屆時將於亞洲、美國、歐洲等地同步進行；俟第三期臨床試驗成功，PI-88可望成為全球第一個預防肝癌復發的新藥。

本著PI-88的成功經驗，基亞公司持續與國內外各大生技公司、藥廠、醫學中心、學術研發機構等洽談合作方案；以治療肝臟相關疾病及癌症兩項核心專長為主，慢性病及其它具開發價值適應症產品為輔，協助新藥、新治療方式早日邁向上市之路。