基亞生物科技股份有限公司（以下簡稱基亞公司）成立於1999年12月31日，為國內企業界響應政府推動生物科技發展策略，專注於開發抗癌與抗肝臟疾病新藥而成立的研發型生技公司。目前基亞公司的實收資本額約新台幣7億1000萬元(約合美金2,150萬元)，主要法人股東包括國內殷實上市公司或知名企業，如云辰電子公司、大同公司、大慶建設公司、幸福水泥集團等。基亞為公開發行公司，股票登錄於台灣興櫃市場。
基亞公司於創立伊始，與澳洲Progen製藥公司(Progen Pharmaceuticals)共同開發血管阻斷性抗癌藥物PI-88；雙方約定在策略聯盟的架構下，分別執行符合美國食品暨藥物管理局(FDA)規範的臨床試驗。經過數年的努力，基亞公司成功地完成了PI-88抗肝癌的第二期臨床試驗，展現令人振奮的人體試驗結果。由於臨床試驗成果受美國FDA的肯定，澳洲Progen製藥公司基於實際的需要，於2007年初決定購回基亞公司所擁有的PI-88權利，並以歸還技術股權、現金、Progen股票等方式，分期回饋基亞公司。在結束與澳洲Progen公司的策略聯盟合約後，基亞公司隨即於2008年初，與日本的Oncolys BioPharma公司簽訂合約，共同發展OBP-301專題。該案係一新穎的溶瘤病毒(Oncolytic Virus)，可用於治療各種癌症，目前在美國進行的FDA第一期臨床試驗已近尾聲。基亞公司現有的新藥開發研發管線(Development Pipeline)中，涵蓋數個與癌症治療有關的臨床前專題；預定在近期內再擴充納入1~2個與肝癌治療有關的專題，使研發管線更加完整。
除新藥開發的業務之外，基亞公司自2005年起即積極規劃開發核酸檢驗試劑(Nucleic Acid Test)，作為公司的第二個技術平台與產品系列；2006年併購美國Texas BioGene Inc公司，迅速建立高階核酸檢驗技術平台；2007年核酸檢驗系列的第一個產品人類白血球抗原(HLA)檢驗試劑通過醫療器材優良製造規範(GMP)審查，2007年通過台灣衛生署查驗登記、美國FDA 510(k) 與歐盟CE Mark認證，該產品目前行銷全球。除HLA檢驗試劑的開發與行銷之外，基亞公司也積極在中國展開佈局。基亞公司透過子公司取得控股的「上海浩源生物科技有限公司」，擁有中國試劑廠GMP(優良製造規範)證照，已成功開發可同時檢測B型肝炎病毒，C型肝炎病毒及愛滋病毒的核酸檢驗血篩試劑，完成10萬份臨床檢測，於2008年向中國衛生部遞件申請審批，可望在2009年上半年取得證照，全面展開中國血液製品廠與全國各血庫、血站的銷售。除上述已開發、認證的核酸檢驗產品外，基亞公司仍積極開發其他與病原體檢驗或遺傳疾病有關的新產品，進一步擴大公司獲利的基礎與規模。
基亞公司在現有的新藥開發與核酸檢驗「雙核心事業處」的基礎下，持續與國內外各大學、研究機構或其他生物科技公司尋求資源互補與合作開發的機會，期能擴大研發能量與業務規模，開發一系列具有完整專利保護，且與癌症或肝臟疾病的偵測、診斷、治療、預防有關的藥物與新技術，以創造利潤，並嘉惠廣大的病患。